耳垂里有硬疙瘩且伴有疼痛，可能是由以下原因引起：
1.皮脂腺囊肿：由于皮脂腺排泄管阻塞，皮脂腺囊状上皮被逐渐增多的内容物膨胀所形成的潴留性囊肿。这是一种良性疾病，通常不会恶变，但如果继发感染，可出现疼痛。
2.瘢痕疙瘩：耳垂部位受到外伤或感染后，可能会形成瘢痕疙瘩，表现为质地坚硬、伴有疼痛的肿物。
3.疖肿：这是一种毛囊及其深部周围组织的感染，多由金黄色葡萄球菌感染引起。初起为毛囊性炎症丘疹，后逐渐增大，形成红色硬性结节，伴有疼痛。
4.其他：耳垂里有硬疙瘩且伴有疼痛，还可能是脂肪瘤、表皮样囊肿、痛风石等原因引起。
如果发现耳垂里有硬疙瘩且伴有疼痛，建议及时就医，以明确诊断，并采取相应的治疗措施。在就医前，应避免自行挤压或搔抓肿物，以免加重病情。