小肠疝气主要是因为腹壁存在薄弱环节，同时腹内压力增高导致腹腔内的脏器或组织通过薄弱点突出到体表形成。比如先天性因素，在胎儿发育过程中，男性的睾丸会通过腹股沟管下降到阴囊，这就会形成一个潜在的通道，若出生后通道没有完全闭合，就可能引发疝气，这种情况在早产儿中的发生率相对高一些。
先天发育因素：
胚胎时期的遗留问题：在胚胎发育阶段，男性的睾丸从腹腔下降到阴囊，会带着腹膜形成鞘状突。正常情况下，出生前后鞘状突应该闭合。如果鞘状突没有闭合，就会形成先天性的疝囊，腹腔内的肠管等组织就有可能通过这个未闭合的鞘状突突出，引发腹股沟疝等小肠疝气。而且早产儿由于发育相对不成熟，鞘状突闭合不全的概率比足月儿要高。女性也有相关潜在通道：女性虽然没有睾丸下降的过程，但也存在一些先天的薄弱区域，只是相对男性来说，发生小肠疝气的概率相对低一些，但同样可能因先天发育因素出现问题。
后天因素导致：
腹内压力长期增高：长期慢性咳嗽是常见的导致腹内压增高的原因。比如有慢性支气管炎的病人，长期咳嗽会使腹腔内压力反复升高，不断冲击腹壁薄弱处，久而久之就容易引发小肠疝气。一般咳嗽时间超过3个月，就会明显增加患疝气的风险。还有便秘的人，排便时需要用力屏气，这也会使腹内压力升高，长期便秘的人群患小肠疝气的几率比排便正常的人要高。另外，从事重体力劳动的人，由于经常需要用力搬运重物，腹内压力反复波动，也容易导致小肠疝气的发生。腹壁强度降低：老年人随着年龄增长，腹壁肌肉、筋膜等组织会逐渐退变，变得薄弱，这是老年人容易患小肠疝气的重要原因。据统计，60岁以上的老年人患小肠疝气的比例明显高于年轻人。还有一些人因为外伤、手术等原因导致腹壁组织受损，腹壁强度降低，比如做过腹部手术的患者，手术切口部位的腹壁组织在愈合过程中可能会出现薄弱，日后就可能发生疝气。
其他相关因素：
肥胖因素：肥胖人群腹部脂肪堆积较多，腹腔内压力相对较高，同时腹壁承受的压力也增大，会增加腹壁薄弱区域承受的力量，从而更容易引发小肠疝气。研究发现，体重指数超过30的肥胖者，患小肠疝气的风险比正常体重者高出约2 - 3倍。遗传因素：有家族史的人患小肠疝气的几率相对较高。如果家族中有亲属患过小肠疝气，那么其自身患病的风险可能比没有家族史的人要高1 - 2倍，这可能与家族遗传导致的腹壁结构等方面的先天性差异有关。