口舌生疮的原因有多种。一般来说，缺乏维生素是常见原因之一，比如人体缺乏维生素B₂时，约有1/3的人会出现口舌生疮的情况。
一、营养缺乏因素
维生素缺乏： 当身体缺乏维生素B族时，尤其是维生素B₂、B6等，会影响口腔黏膜的正常代谢，容易引发口舌生疮。像长期挑食、偏食的人，很容易出现维生素摄入不足的情况。另外，缺乏铁、锌等微量元素也可能导致口舌生疮，有研究发现，约20%的口舌生疮患者存在铁或锌的缺乏。营养不良： 长期营养不良会使身体的抵抗力下降，口腔黏膜的修复能力减弱，从而增加口舌生疮的发生几率。比如一些节食减肥的人群，由于营养摄入不均衡，就比较容易出现这种情况。
二、口腔局部刺激因素
创伤性因素： 牙齿咬伤、刷牙时用力过猛损伤口腔黏膜等，都可能导致口舌生疮。比如不小心咬到舌头或口腔内壁，伤口如果没有及时愈合，就容易引发炎症，出现生疮的情况。另外，不合适的假牙、牙套等长期摩擦口腔黏膜，也会造成局部损伤，进而引发口舌生疮。口腔卫生不良： 不注意口腔清洁，口腔内细菌滋生，会破坏口腔的微生态环境，容易诱发口舌生疮。比如晚上睡觉前不刷牙，食物残渣在口腔内残留，经过一夜的发酵，会滋生大量细菌，刺激口腔黏膜，导致生疮。
三、全身性疾病因素
消化系统疾病： 患有胃溃疡、十二指肠溃疡、胃炎等消化系统疾病时，会影响营养物质的吸收，同时可能导致体内激素水平失衡，从而增加口舌生疮的发生风险。例如，有研究表明，约40%的复发性口舌生疮患者伴有消化系统疾病。免疫系统疾病： 像白塞病等免疫系统疾病，会使机体的免疫系统出现异常，导致口腔黏膜反复受到炎症攻击，引发口舌生疮。白塞病患者除了口舌生疮外，还可能出现眼部、生殖器等部位的病变。内分泌紊乱： 女性在月经周期前后或怀孕期间，体内的激素水平会发生变化，容易出现内分泌紊乱，进而引发口舌生疮。比如有些女性在月经前期，由于雌激素水平的波动，就比较容易出现口舌生疮的情况。