口舌生疮的原因有多种。一般来说，机体免疫力下降时容易引发口舌生疮，比如当人体处于疲劳状态后，约有40%-50%的人会出现口舌生疮情况。
缺乏维生素引起
维生素B族缺乏： 尤其是维生素B2（核黄素）缺乏时，很容易导致口舌生疮。正常成年人每天维生素B2的推荐摄入量男性约1.4毫克，女性约1.2毫克，长期摄入不足就可能引发问题。维生素C缺乏： 人体缺乏维生素C时也可能出现口舌生疮现象，一般人体每天需要摄入约100毫克的维生素C，长期不足会影响机体正常代谢，增加口舌生疮风险。
口腔局部刺激导致
牙齿创伤： 比如牙齿有锐利的边缘、残根或者不合适的假牙等，长期摩擦口腔黏膜，就会引起口舌生疮。据统计，因牙齿创伤导致口舌生疮的人群中，约有30%-40%是因为牙齿残根刺激引起。不良饮食习惯： 经常吃辛辣刺激性食物，像辣椒、花椒等，会对口腔黏膜产生刺激，容易引发口舌生疮。比如连续一周每天大量食用辛辣食物，就有较大概率出现口舌生疮情况。
疾病因素引发
口腔溃疡疾病： 复发性阿弗他溃疡是常见的引发口舌生疮的疾病，其发病机制尚不完全明确，可能与遗传、免疫、环境等多种因素有关，有20%-30%的人群会受到复发性阿弗他溃疡的困扰。全身性疾病： 像患有糖尿病时，血糖控制不佳会影响机体免疫功能和口腔黏膜的修复，容易出现口舌生疮；还有一些免疫系统疾病，如白塞病，也常常会表现出口舌生疮的症状，白塞病患者中约有50%-60%会出现口腔黏膜溃疡表现。