食管粘膜损伤后，常见的症状有咽部异物感，大概有60% - 70%的食管粘膜损伤患者会出现这种情况，感觉喉咙里好像卡了东西一样。另外，疼痛也是常见症状，多数患者会有不同程度的胸骨后疼痛，疼痛程度轻重不一，有的像针刺样，有的是烧灼样。
局部表现情况
吞咽疼痛： 吞咽时会感觉到疼痛，尤其是在吞咽较热、较冷或刺激性食物时，疼痛会更加明显。一般在食管粘膜损伤后的数小时内就可能出现这种吞咽疼痛的症状。吞咽困难： 轻度的食管粘膜损伤可能不会导致明显的吞咽困难，但较严重的损伤可能会使患者吞咽食物时有梗阻感。比如吃固体食物时，会感觉食物下行不顺畅。
全身可能出现的症状
出血表现： 少量的食管粘膜损伤可能仅表现为痰中带血，或者大便隐血试验阳性。而如果损伤比较严重，可能会出现呕血的情况，出血量较多时，呕出的血可能是鲜红色，也可能是暗红色。发热： 部分患者在食管粘膜损伤后可能会出现低热，体温一般在37.5℃ - 38℃左右，这是因为身体对损伤产生炎症反应所致。但如果体温超过38.5℃，并且持续不退，可能提示有感染等其他并发症。
不同原因导致的特殊症状
腐蚀性物质引起的损伤： 如果是误服强酸、强碱等腐蚀性物质导致的食管粘膜损伤，除了上述症状外，还会有剧烈的烧心感，同时可能会出现口腔、咽喉的灼伤表现，如口腔黏膜充血、溃烂等。而且这种损伤往往比较严重，可能会导致食管狭窄等严重并发症。剧烈呕吐引起的食管粘膜损伤： 因剧烈呕吐造成的食管粘膜损伤，患者除了有食管部位的疼痛、吞咽不适外，可能还会有原发病的表现，比如有导致呕吐的胃肠道疾病相关症状，像恶心不止、原发病部位的疼痛等。