慢性胃肠炎常见的症状有消化系统相关表现以及可能伴随的全身症状等。一般来说，慢性胃肠炎患者消化系统方面可能会有长期的腹痛，疼痛程度多为隐痛，时间可持续数周甚至数月不等；还会出现腹胀，尤其是在进食后较为明显，部分人腹胀可间断发作。
消化系统症状表现
腹痛情况： 多数慢性胃肠炎患者会有腹部隐痛，疼痛部位多在肚脐周围或者上腹部，疼痛没有明显的规律性，可能在进食后加重或者缓解不明显。比如有的患者会感觉肚子隐隐作痛，持续好几天都不缓解。腹胀现象： 患者常常会有腹部胀满的感觉，吃一点东西就觉得肚子饱胀，而且这种腹胀感会持续较长时间，有时即使没有进食，也会觉得肚子鼓鼓的。像有些患者会说自己整天肚子都是胀的，影响食欲。恶心呕吐： 部分慢性胃肠炎患者会出现恶心的症状，严重时可能会伴有呕吐，呕吐物多为胃内的容物，一般不是剧烈的呕吐，但会反复出现。例如有的患者时不时就会觉得恶心，偶尔会吐出一些未消化的食物。食欲减退： 患者的食欲会明显下降，不想吃东西，即使面对平时喜欢的食物也提不起兴趣，长期如此可能会导致体重下降。
全身症状表现
乏力疲倦： 由于胃肠道长期不适，影响了营养的吸收，患者会经常感到乏力、疲倦，稍微活动一下就觉得很累，精神状态不佳。比如原本能走一段路不觉得累，患了慢性胃肠炎后，走一小段路就感觉没力气了。消瘦： 因为消化吸收功能受到影响，身体得不到充足的营养供应，患者会逐渐消瘦，体重会有明显的下降，尤其是病程较长的患者，消瘦情况可能比较明显。
其他可能症状
大便异常： 慢性胃肠炎患者的大便也会出现异常，有的表现为大便次数增多，每天排便3 - 5次甚至更多，大便不成形，呈稀糊状或者水样；有的则是大便干结，排便困难。还有的患者大便中可能会带有少量黏液。比如有的患者每天大便次数增多，而且大便很稀，像拉肚子一样；而有的患者好几天才排一次大便，大便干结难解。