怀孕50天B超看不到孕囊，可能是以下原因导致：
1.生理因素：
实际孕周偏小：可能是由于受精卵着床时间较晚，导致实际孕周偏小，B超检查未能发现孕囊。
月经不规律：如果女性的月经周期不规律，排卵时间不固定，受孕时间较晚，孕囊可能尚未发育到可以通过B超看到的程度。
2.病理因素：
宫外孕：受精卵在子宫体腔以外的部位着床发育，称为宫外孕。宫外孕时，B超检查在子宫内看不到孕囊。
胚胎发育不良：如果孕囊发育异常，如存在染色体异常或其他结构问题，可能会导致胚胎停止发育，B超也无法看到孕囊。
其他：子宫肌瘤、子宫畸形等子宫疾病，也可能影响孕囊的着床和发育，导致B超看不到孕囊。
需要注意的是，以上情况只是一些可能的原因，具体情况需要结合个人的具体情况和医生的进一步检查来确定。如果怀孕50天B超看不到孕囊，医生可能会建议进行以下检查：
1.血液检查：如人绒毛膜促性腺激素（hCG）和孕酮水平的测定，以帮助判断孕囊的发育情况。
2.复查B超：通常会在一周后进行复查，以确定孕囊的位置和发育情况。
3.其他检查：根据具体情况，医生可能还会建议进行其他检查，如阴道超声、宫腔镜等，以明确诊断。
在等待检查和进一步诊断的过程中，孕妇应保持冷静，遵循医生的建议，注意休息，避免剧烈运动和性生活。如果出现阴道流血、腹痛等异常情况，应及时就医。
如果最终确诊为宫外孕或胚胎发育不良等异常情况，医生可能会根据具体情况采取相应的治疗措施，如手术治疗或药物治疗。如果孕囊发育正常，孕妇则可以继续妊娠，并按时进行产前检查。
总之，怀孕50天B超看不到孕囊需要引起重视，但也不必过于紧张。及时就医，进行详细的检查和诊断，以便采取适当的措施。同时，孕妇应保持良好的心态，注意孕期保健，为胎儿的健康发育提供良好的条件。