怀孕50天B超看不到孕囊，可能是以下原因：
1.受孕时间较短：受精卵可能还没有到达子宫，或者着床时间较晚，导致孕囊还无法在B超中显示。可以等待一段时间后再进行复查。
2.宫外孕：孕囊可能没有在子宫内着床，而是在输卵管、卵巢等其他部位，这种情况非常危险，需要及时就医。
3.生化妊娠：虽然受精卵已经着床，但胚胎发育不良，没有形成孕囊就自然流产了。这种情况通常会伴随着月经来潮，类似于自然流产。
4.孕囊发育不良：孕囊可能存在发育问题，如孕囊过小、形态不规则等。这种情况下，需要密切观察孕囊的发育情况。
5.其他因素：子宫肌瘤、子宫内膜息肉等也可能影响孕囊的显示。
需要注意的是，每个人的情况都可能不同，如果怀孕50天B超看不到孕囊，应及时咨询医生，进行进一步的检查和诊断。医生会根据具体情况给出个性化的建议和治疗方案。同时，在等待检查结果的过程中，应注意休息，避免剧烈运动和性生活，保持良好的心态。如果出现阴道流血、腹痛等异常情况，应立即就医。