胎记形成的原因主要和胚胎发育过程中的变化有关。一般来说，胎记是由于皮肤组织在发育时异常的增生，在皮肤表面出现形状和颜色的异常。
血管型胎记的形成
毛细血管型胎记：这是比较常见的一种，是因为胚胎发育时，特定部位的毛细血管发育异常导致。比如鲜红斑痣，是由于胚胎时期，支配血管的神经缺乏，使得毛细血管扩张充血，在出生时或出生后不久就会出现，表现为淡红色或暗红色的斑片，不会自行消退。海绵状胎记：主要是由扩张的血管构成，这些血管像海绵一样。它的形成是在胚胎发育的早期，原始的内皮细胞群与血管网脱离，在其他部位异常生长形成海绵状的血管团，多在出生时或出生后不久出现，可发生在身体的多个部位。
色素型胎记的形成
太田痣：一般认为是胚胎发育时，黑素细胞从神经嵴向表皮移行的过程中，部分黑素细胞掉队，停留在真皮层导致。通常在婴儿期或儿童期开始出现，呈蓝色、灰蓝色、褐色等斑片或斑点，单侧分布，常见于面部的单侧，如眼周、颊部等部位。咖啡斑：病因目前尚不十分明确，可能与遗传因素有关。它是一种边界清楚的色素沉着斑，颜色从浅褐色至深褐色不等，可在出生时或出生后不久出现，并且会随着年龄增长而逐渐变大、颜色变深，大小不一，形状可为圆形、卵圆形或不规则形。
蒙古斑的形成
蒙古斑是由于胚胎发育时，黑素细胞停留在真皮深部而引起的。多见于婴儿的腰骶部、臀部等部位，表现为蓝色或蓝黑色的斑片，通常在学龄前会逐渐自行消退，这是一种比较常见的良性胎记，在东方人种中较为多见，发生率可达80%左右的婴儿会出现蒙古斑。