孕早期黄体酮低的原因包括胚胎本身问题、肾上腺或甲状腺功能失调、黄体功能不全等，此外还可能与胚胎染色体异常、异位妊娠等有关，应及时到医院就诊，确诊后对症治疗。
一、胚胎本身问题：若父亲提供的精子质量差以及母亲的卵细胞发育不好等，导致父母所提供的精子和卵子都存在异常，那么就会使胚胎质量有问题，进而可能造成黄体酮低。此时患者可就医进行相关检查，而后在医生指导下选择适宜的治疗方式。
二、肾上腺或甲状腺功能失调：当患者的肾上腺、甲状腺功能出现异常时，也有可能引起黄体酮低。对于这种情况，需要在医生指导下进行对症治疗。
三、黄体功能不全：这可能和卵泡生长障碍、原发病等因素相关，发病时会让患者出现流产现象。可在医生指导下使用地屈孕酮、黄体酮、氯米芬等药物来进行治疗。
总之，孕早期黄体酮低的原因多样，要尽快就医检查，明确具体病因，以免延误病情。