右侧附件囊肿是否会影响怀孕，需分情况来看。一般来说，直径小于5厘米的生理性囊肿，通常不会影响怀孕，这类囊肿多在月经后缩小或消失；而直径大于5厘米的病理性囊肿，可能会影响怀孕，大约有15% - 30%的此类囊肿会对受孕产生影响。
囊肿性质不同影响有别
生理性囊肿： 常见的如卵泡囊肿和黄体囊肿，多在月经周期中出现，一般直径小于5厘米。通常不会影响卵巢的正常排卵和输卵管的功能，对怀孕的影响较小。比如在排卵期形成的卵泡囊肿，只要不影响卵子的排出以及后续输卵管拾取卵子和输送受精卵的过程，就不会明显干扰怀孕。病理性囊肿： 像巧克力囊肿（子宫内膜异位囊肿）、浆液性囊腺瘤、黏液性囊腺瘤等。巧克力囊肿会影响卵巢的排卵功能，还可能导致盆腔粘连，影响输卵管的蠕动和拾卵功能，从而降低受孕几率。据统计，患有巧克力囊肿的女性，自然受孕率比正常女性低约50%左右。而浆液性囊腺瘤等较大的病理性囊肿，可能会占据卵巢空间，压迫正常卵巢组织，影响卵子的生成和排出，进而影响怀孕。
囊肿大小与怀孕的关联
囊肿较小（直径≤5厘米）： 如果右侧附件囊肿直径≤5厘米，且通过检查考虑为良性、非赘生性的，那么对怀孕的影响相对较小。但仍需要定期复查，观察囊肿的变化情况。因为少数较小的囊肿也可能在孕期发生扭转等意外情况，不过这种概率相对较低。一般每1 - 2个月复查一次B超，监测囊肿大小和形态。囊肿较大（直径>5厘米）： 当右侧附件囊肿直径大于5厘米时，发生扭转、破裂等并发症的风险增加，而且较大的囊肿会影响卵巢的正常结构和功能，明显影响怀孕。此时通常需要手术干预，比如进行囊肿剔除术等，术后恢复一段时间再考虑怀孕。一般建议手术后3 - 6个月，经医生评估身体状况良好后再尝试受孕。
囊肿对不同阶段怀孕的影响
备孕阶段： 在备孕期间发现右侧附件囊肿，如果囊肿较小且为生理性，可正常备孕，但要密切监测囊肿情况。如果是较大的病理性囊肿，建议先治疗囊肿再备孕。因为较大的囊肿可能在备孕过程中出现并发症，影响受孕。比如巧克力囊肿在备孕时，由于盆腔环境的改变，可能会导致病情进展，进一步影响受孕。孕期： 孕期发现右侧附件囊肿也需要关注。如果是孕期生理性囊肿，一般不需要特殊处理，多数会在产后自行消退。但如果是病理性囊肿且在孕期增大明显，可能会引起腹痛等不适，甚至发生扭转，危及母胎安全。这时候需要根据具体情况，由医生决定是密切观察还是采取手术等措施。比如孕期发现囊肿直径迅速增大，超过6厘米，且有腹痛等症状，可能需要及时手术。