右附件囊肿是否会影响怀孕，需分情况来看。一般来说，直径小于5厘米的单纯性囊肿，对怀孕影响相对较小，约有80%左右的女性可能正常受孕；但如果囊肿较大或为病理性囊肿，就可能影响怀孕。
囊肿大小与性质对怀孕的影响
小囊肿（直径＜5厘米）：多数为生理性囊肿，比如滤泡囊肿或黄体囊肿，常在月经周期变化中出现，一般在2 - 3个月经周期后可自行消失，对怀孕影响不大，通常不影响受孕过程，女性仍有较大机会自然怀孕。大囊肿（直径≥5厘米）：可能会占据盆腔空间，影响输卵管的正常功能，阻碍卵子与精子的结合，还可能压迫卵巢组织，影响排卵，这种情况下怀孕几率会降低，大约有30% - 40%的女性可能受影响。而且大囊肿还有发生扭转的风险，一旦扭转会引起剧烈腹痛，需要急诊手术，这也会对怀孕计划产生干扰。
囊肿类型对怀孕的影响
巧克力囊肿：这是子宫内膜异位症的一种表现，约30% - 50%的子宫内膜异位症患者会出现不孕。巧克力囊肿会导致盆腔内环境改变，影响输卵管的拾卵功能和蠕动功能，还会影响卵巢的排卵及黄体功能，从而明显降低怀孕几率。浆液性或黏液性囊腺瘤：属于良性肿瘤，但较大的囊腺瘤可能会破坏卵巢组织，影响卵巢的正常功能，进而影响排卵和激素分泌，对怀孕有一定影响，怀孕几率相比正常女性会降低20% - 30%左右。
治疗方式对怀孕的后续影响
保守治疗后：如果是通过药物等保守治疗的囊肿，在治疗后需要观察卵巢功能恢复情况。有些女性在保守治疗后可能会出现卵巢粘连等情况，这会影响输卵管与卵巢的关系，从而影响受孕。一般保守治疗后3 - 6个月需要评估受孕情况，如果仍未怀孕，可能需要进一步处理。手术治疗后：手术治疗囊肿后，需要看手术对卵巢和输卵管的影响程度。如果是单纯剥除囊肿，保留了较多卵巢组织，一般术后3个月左右可以尝试怀孕，怀孕几率相对还是比较可观的，约50% - 60%；但如果手术范围较大，破坏了较多卵巢组织，怀孕几率会明显降低，可能只有20% - 30%左右，而且术后还需要警惕盆腔再次粘连等问题影响怀孕。