右附件囊肿是否会影响怀孕，需分情况来看。一般直径小于5厘米的单纯性囊肿，对怀孕影响较小，约有80%左右的女性仍可自然受孕；但如果囊肿直径大于5厘米，或为巧克力囊肿、畸胎瘤等特殊类型囊肿，就可能影响怀孕。
囊肿大小与怀孕的关系
直径小于5厘米的单纯性囊肿：这类囊肿多为生理性，如黄体囊肿等，通常会在月经后自行消失。对卵巢的正常排卵和输卵管拾卵功能影响较小，一般不影响受孕，女性仍有较大机会自然怀孕。直径大于5厘米的囊肿：较大的囊肿可能会压迫卵巢组织，影响卵巢的正常排卵功能，还可能导致输卵管受压，影响卵子与精子的结合以及受精卵的运输，从而降低受孕几率，甚至可能引起宫外孕等情况。
囊肿性质与怀孕的关系
巧克力囊肿：这是子宫内膜异位症的一种表现，会影响卵巢的正常功能，破坏卵巢组织，干扰排卵，还会改变盆腔内环境，影响受精卵的着床，使得怀孕难度增加，据统计，约30% - 50%的巧克力囊肿患者会出现不孕。畸胎瘤：畸胎瘤可能会扭转卵巢血管，影响卵巢血供，而且肿瘤的存在可能会干扰卵巢的正常生理功能，进而影响怀孕，同时，畸胎瘤在孕期还有可能发生变化，需要及时处理。
对孕期的影响
即使怀孕前右附件囊肿未影响受孕，孕期囊肿也可能发生变化。比如孕期囊肿可能会随着子宫增大而受到影响，出现扭转、破裂等紧急情况，威胁母胎安全。如果是恶性囊肿，还会严重危及孕妇生命和胎儿健康。所以怀孕前发现右附件囊肿，应根据具体情况咨询医生，必要时先处理囊肿再备孕。