肝胆管结石的症状多样，部分患者可能长期无症状，而有症状者主要表现为以下几方面。首先，腹痛较为常见，多为右上腹或上腹部隐痛、胀痛或绞痛，有时疼痛会放射至肩背部，发作时间可能从几分钟到数小时不等。
疼痛表现
隐痛情况： 患者可能会感到右上腹或上腹部有持续的轻度疼痛，这种疼痛可能在进食油腻食物后加重，有时会被患者误以为是消化不良而忽视。绞痛情况： 当结石引起胆管梗阻时，可能会出现剧烈的绞痛，疼痛如刀割般难以忍受，发作时患者往往辗转不安，疼痛可持续数分钟至数小时。
消化道症状
恶心呕吐： 不少肝胆管结石患者会出现恶心、呕吐的症状，尤其是在疼痛发作时，呕吐后症状可能不会立即缓解。例如，有的患者进食后就容易出现恶心，随后可能呕吐出胃内容物。食欲减退： 患者会感觉食欲下降，对食物的兴趣降低，不想吃东西，长期如此可能导致体重减轻。
黄疸表现
皮肤巩膜黄染： 当结石导致胆管梗阻合并感染时，可能会出现黄疸，表现为皮肤和巩膜发黄。黄疸程度有轻有重，轻度黄疸可能只是皮肤稍微发黄，重度黄疸则全身皮肤明显发黄，同时尿液颜色会加深，像浓茶一样，而粪便颜色可能会变浅。伴随症状： 出现黄疸时，患者可能还会伴有瘙痒，这是因为血液中胆红素升高刺激皮肤神经末梢引起的，瘙痒可能会影响患者的睡眠和日常生活。