肝内胆管结石的症状表现多样，部分患者可能没有明显症状，而有些患者会出现腹痛、黄疸等表现。比如约1/3的患者可能长期没有症状，仅在体检时发现。
腹痛表现
右上腹隐痛： 这是比较常见的腹痛形式，多是因为结石在胆管内移动，刺激胆管引起。疼痛程度一般较轻，可能持续一段时间后缓解，但容易反复出现。胆绞痛： 当结石引起胆管梗阻时，就可能突发右上腹或上腹部剧烈疼痛，疼痛可向右肩或背部放射，疼痛程度较为剧烈，患者常难以忍受，还可能伴有恶心、呕吐等症状，这种情况可能会持续数小时。
黄疸表现
皮肤和巩膜黄染： 当结石导致胆管梗阻合并感染时，就可能出现黄疸。此时患者的皮肤会发黄，巩膜（眼白部分）也会变黄。黄疸程度有轻有重，轻度黄疸可能只是皮肤稍微有点发黄，重度黄疸则全身皮肤明显发黄。尿色改变： 患者的尿液颜色会加深，呈现浓茶色，这是因为胆红素进入尿液导致的。而粪便颜色可能会变浅，呈现陶土色。
其他表现
发热： 由于胆管梗阻后容易合并感染，患者可能会出现发热症状，体温一般在38℃~39℃左右，有的患者体温可能更高。消化道症状： 患者可能会有食欲不振、恶心、呕吐、腹胀等消化道不适症状，这是因为胆管结石影响了胆汁的正常排泄，进而影响了消化功能。如果病情反复发作，还可能导致患者消瘦等情况。