急性肺栓塞的治疗需要及时进行，一般来说，治疗方法包括药物治疗、手术治疗等。其中药物治疗是基础，比如使用抗凝药物是常用的手段之一。
药物治疗方面
抗凝治疗： 常用的抗凝药物有肝素、低分子肝素和华法林等。肝素一般通过静脉给药，能迅速发挥抗凝作用，可在数小时内使凝血指标达到治疗范围；低分子肝素皮下注射即可，相对更方便，出血风险较普通肝素稍低；华法林是口服抗凝药，需要监测国际标准化比值（INR）来调整剂量，一般需要数天才能达到稳定的抗凝效果。溶栓治疗： 对于大面积肺栓塞（有明显呼吸困难、胸痛、低氧血症等），在发病14天内可考虑溶栓治疗。常用的溶栓药物有尿激酶、链激酶和重组组织型纤溶酶原激活剂（rt-PA）等。尿激酶可直接激活纤溶酶原转化为纤溶酶，溶解血栓；链激酶是一种生物制品，能激活体内纤溶酶原形成纤溶酶发挥溶栓作用；rt-PA选择性地激活血栓中的纤溶酶原，溶栓效果较好但价格相对较高。
手术治疗情况
肺动脉血栓摘除术： 这是一种比较激进的手术方式，适用于经积极的内科治疗无效的紧急情况，比如患者出现休克等严重表现。手术风险相对较高，需要在具备良好条件的医院，由经验丰富的外科医生操作。导管碎解和抽吸血栓： 利用特殊的导管设备，在血管内将血栓碎解并抽吸出来，可作为辅助治疗手段，尤其适用于那些不能进行溶栓或溶栓禁忌的患者，但该方法有一定的技术要求和适用范围。
一般支持治疗
呼吸支持： 如果患者有低氧血症，需要给予吸氧治疗，根据病情严重程度，可能采用鼻导管吸氧、面罩吸氧甚至机械通气等方式。一般轻度低氧可以通过鼻导管给予2 - 4升/分钟的氧气；中重度低氧可能需要更高流量或采用机械通气维持患者的氧合。循环支持： 对于出现低血压等循环不稳定的患者，需要积极补充血容量，必要时使用血管活性药物来维持血压，如多巴胺等药物可根据患者血压情况调整剂量来维持合适的血压水平，保证重要脏器的灌注。同时要密切监测患者的生命体征，如心率、血压、血氧饱和度等指标的变化。