肾阳虚主要是多种因素长期作用引起的。比如，年龄因素是一个方面，随着年龄增长，人体的肾气逐渐衰退，50岁以上人群相对更容易出现肾阳虚的情况。长期过度劳累也是常见诱因，长时间从事重体力劳动或者脑力劳动，会消耗过多体力和精力，损伤肾阳。还有不良生活习惯，像长期熬夜，长期熬夜会影响人体的阴阳平衡，导致肾阳不足，临床观察发现，经常熬夜的人群中肾阳虚的发生率比作息规律人群高约30%。另外，久病不愈也会损伤肾阳，一些慢性疾病如慢性肾病、慢性支气管炎等，病程较长，会耗伤人体阳气，进而引发肾阳虚。
先天禀赋不足
遗传因素：如果家族中有肾阳虚的遗传倾向，那么后代出生时就可能存在肾阳相对不足的情况。比如家族中多人有畏寒怕冷、腰膝酸软等肾阳虚表现，其子女先天肾阳较弱的概率会比普通人群高。母体因素：孕妇在孕期如果身体状况不佳，比如患有某些疾病、营养不良等，也可能影响胎儿的肾阳禀赋。例如孕期母亲严重贫血，胎儿在宫内获取的营养不足，可能导致出生后肾阳不足。
外邪侵袭
寒邪入侵：长期处于寒冷潮湿的环境中，寒邪容易侵袭人体，损伤肾阳。像在寒冷地区生活或者冬季不注意保暖，人体长时间受到寒邪侵犯，就会影响肾阳的功能。研究表明，长期处于0℃以下环境工作的人群，肾阳虚的患病率比常温环境人群高40%左右。湿邪困阻：湿邪重浊黏腻，容易阻碍阳气的运行。当人体长时间处于潮湿环境，或者饮食不节导致体内湿邪内生，湿邪困阻阳气，日久就会损伤肾阳。比如经常居住在地下室等潮湿场所，或者喜欢吃肥甘厚味、辛辣油腻食物，容易生湿，进而影响肾阳。
房事不节
过度性生活：性生活过于频繁会耗伤肾阳。正常的性生活本是阴阳调和之事，但如果过度，就会使肾阳过度消耗。一般来说，青壮年时期如果每周性生活超过3次且长期如此，就可能增加肾阳虚的发生风险。手淫过度：青少年时期频繁手淫也会损伤肾阳。手淫过度会导致肾精耗损，而肾中精气是肾阳的物质基础，肾精耗损过多就会引起肾阳不足，临床发现很多青少年肾阳虚患者都有长期手淫史。