屁眼痒痒可能由多种原因引起，比如约有60%的肛门瘙痒是由局部因素导致的，像肛门局部不清洁，长时间残留粪便、分泌物等刺激肛周皮肤就容易引发瘙痒。
局部皮肤问题导致
肛周湿疹：这是常见原因之一，多与过敏、潮湿等有关。患者肛周皮肤会出现红斑、丘疹、水疱等，伴有剧烈瘙痒，搔抓后可能会糜烂、渗出。一般病程较长，容易反复发作。痔疮：当痔疮发作时，尤其是内痔脱出或外痔肿胀，会导致分泌物增多，这些分泌物刺激肛周皮肤，也会引起瘙痒。比如Ⅲ度、Ⅳ度内痔经常脱出，就更容易出现屁眼痒痒的情况。
寄生虫感染引发
蛲虫感染：多见于儿童，尤其是5 - 10岁的儿童。雌蛲虫会在夜间爬出肛门产卵，刺激肛周皮肤，引起剧烈瘙痒，尤其在夜间睡眠时瘙痒会加重。可以在夜间肛周皮肤皱襞处发现白色细小的蛲虫。
肠道疾病影响
肠道寄生虫病：除了蛲虫，其他肠道寄生虫如蛔虫等如果在肠道内繁殖，也可能通过肠道蠕动等影响肛周，导致屁眼痒痒。另外，肠道炎症性疾病，如溃疡性结肠炎，肠道分泌物增多，可能会刺激肛周，引发瘙痒。
全身性疾病关联
糖尿病：糖尿病患者血糖控制不佳时，尿液中含糖量升高，会刺激肛周皮肤，容易引起瘙痒。据统计，约有10%的糖尿病患者会出现皮肤瘙痒的症状，其中肛周瘙痒是比较常见的部位之一。肝胆疾病：像肝硬化、胆石症等肝胆疾病患者，由于胆汁淤积，血液中胆盐含量升高，会刺激神经末梢，导致皮肤瘙痒，也可能累及肛周出现痒痒的情况。