鼻咽囊肿的症状表现多样，部分患者可能无明显症状，常在体检时偶然发现；而有些患者会出现鼻塞，多为单侧鼻塞，随着囊肿增大，鼻塞可能逐渐加重；还可能有流涕，有时鼻涕中带血；另外，部分患者会感到咽部异物感，吞咽时可能有不适。
一、无症状情况
部分鼻咽囊肿较小且未对周围组织产生压迫等影响时，患者没有任何不适症状，多在进行鼻咽部检查时被发现，比如因其他疾病做鼻咽部影像学检查时偶然发现囊肿存在。
二、鼻塞表现
当鼻咽囊肿逐渐增大，堵塞后鼻孔时，就会引起鼻塞症状，一般是单侧鼻塞，随着囊肿不断增大，可能会发展为双侧鼻塞，影响正常的呼吸通气。
三、流涕与涕中带血
囊肿可能刺激鼻咽部黏膜，导致分泌物增多，出现流涕情况。若囊肿表面黏膜受到刺激、损伤，还可能出现涕中带血现象，但一般血量较少。
四、咽部异物感
鼻咽部有囊肿存在时，患者可能会感觉咽部有异物感，好像有东西卡在那里，吞咽时这种异物感可能会有所不同，有的患者会觉得吞咽时不太顺畅，有不适感。