强直性脊柱炎可能引发多种并发症。约有1/4的强直性脊柱炎患者会出现眼部并发症，比如葡萄膜炎、虹膜炎等，通常是单侧发病，发病比较急，会有眼痛、流泪、视力下降等表现。
骨骼关节相关并发症
脊柱畸形：随着病情进展，脊柱可能会逐渐出现畸形，像驼背就是比较常见的情况，严重时会影响身体的正常活动，导致弯腰、转身等动作受限。髋关节病变：约1/4的患者会累及髋关节，出现髋关节疼痛、活动受限，进而影响行走功能，严重的可能会导致髋关节强直，使患者失去行走能力。
肺部并发症
强直性脊柱炎患者后期可能出现肺部病变，比如肺间质纤维化，患者会逐渐出现咳嗽、咳痰、活动后气短等症状，而且随着病情发展，肺功能会逐渐下降。据统计，有5% - 10%的患者会出现不同程度的肺部受累情况。
心脏并发症
部分强直性脊柱炎患者会合并心脏病变，像主动脉瓣闭锁不全比较常见，患者可能没有明显症状，也可能出现心悸、气短等表现，严重时会影响心脏功能。另外，心脏传导阻滞也可能发生，需要通过心电图等检查来发现。