肛门有白斑能否自愈，与具体病因有关，不能一概而论，常见原因如下：
1.黏膜白斑：主要发生在肛管和肛门周围，可能与局部刺激、内分泌紊乱、营养不良等因素有关。这种情况下，白斑可能会逐渐扩大或融合，一般不会自愈，需要积极治疗，如外用药物（鱼肝油软膏、维A酸乳膏等）、物理治疗（激光、冷冻等）或手术治疗。
2.白癜风：是一种常见的后天性色素脱失性皮肤病，可能与遗传、自身免疫、精神因素等有关。肛门部位也可能出现白斑，呈乳白色或瓷白色，边界清楚，无自觉症状。白癜风的白斑通常不会自愈，需要长期治疗，可采用光疗（UVB、308nm准分子激光等）、外用药物（糖皮质激素、钙调磷酸酶抑制剂等）、口服药物（免疫调节剂、维生素D3衍生物等）或表皮移植等方法。
3.其他：肛门白斑还可能与扁平苔藓、硬化萎缩性苔藓、梅毒等疾病有关。这些疾病的白斑也通常不会自愈，需要针对病因进行治疗。
需要注意的是，以上只是一些常见的原因，肛门有白斑还可能有其他原因。如果发现肛门有白斑，建议及时就医，进行相关检查（如伍德灯检查、皮肤镜检查、组织病理学检查等），以明确诊断，并在医生的指导下选择合适的治疗方法。同时，要注意保持肛门清洁，避免搔抓和摩擦，避免食用辛辣刺激性食物。