甲状旁腺功能亢进主要分为原发性、继发性和三发性三种类型，不同类型病因不同。原发性甲状旁腺功能亢进约80%是由甲状旁腺腺瘤引起，约10% - 15%是由甲状旁腺增生导致，极少数是由甲状旁腺癌引起；继发性甲状旁腺功能亢进通常是因为慢性肾功能不全、维生素D缺乏或抵抗等原因，使得身体长期处于低钙状态，刺激甲状旁腺增生肥大，分泌过多甲状旁腺激素；三发性甲状旁腺功能亢进多是在继发性甲状旁腺功能亢进的基础上，甲状旁腺发生自主性功能亢进，不受正常反馈机制调控。
原发性甲状旁腺功能亢进的病因
甲状旁腺腺瘤： 约80%的原发性甲状旁腺功能亢进是由甲状旁腺腺瘤引起，腺瘤会自主分泌过多的甲状旁腺激素，导致血钙升高。这种腺瘤多为单发，好发于甲状旁腺上、下极部位。甲状旁腺增生： 约10% - 15%的原发性甲状旁腺功能亢进是由甲状旁腺增生导致，通常是4个甲状旁腺都有不同程度的增生，使得甲状旁腺激素分泌增多。
继发性甲状旁腺功能亢进的病因
慢性肾功能不全： 慢性肾功能不全患者，肾脏排磷减少，导致血磷升高，进而使血钙降低，刺激甲状旁腺增生，分泌过多甲状旁腺激素来试图升高血钙。一般肾小球滤过率低于60ml/min/1.73m²时，就可能出现继发性甲状旁腺功能亢进相关变化。维生素D缺乏或抵抗： 维生素D缺乏会影响肠道对钙的吸收，导致血钙降低，刺激甲状旁腺增生。比如日照不足、饮食中维生素D摄入过少等都可能引起维生素D缺乏；而维生素D抵抗则是身体对维生素D的作用不敏感，即使有足够的维生素D，也不能正常发挥升高血钙的作用，同样会导致血钙降低，刺激甲状旁腺。
三发性甲状旁腺功能亢进的病因
三发性甲状旁腺功能亢进多是在继发性甲状旁腺功能亢进的基础上发展而来。在继发性甲状旁腺功能亢进阶段，甲状旁腺已经处于增生状态，长期的刺激使得甲状旁腺发生自主性功能亢进，即使血钙已经正常或升高，甲状旁腺仍持续分泌过多的甲状旁腺激素，失去了正常的反馈调节机制。