甲状旁腺功能亢进主要是由于甲状旁腺本身的病变引起的，比如约80%是由甲状旁腺腺瘤导致的，还有10%左右是甲状旁腺增生引起，极少数是甲状旁腺癌所致。
原发性甲状旁腺功能亢进的常见原因
甲状旁腺腺瘤： 这是最常见的原因，单个甲状旁腺腺瘤可导致甲状旁腺激素分泌过多。通常是甲状旁腺上长出一个良性的小肿瘤，影响了甲状旁腺正常的激素分泌调节机制。甲状旁腺增生： 多腺体增生较为常见，可能与遗传因素、某些代谢紊乱等有关。比如家族性甲状旁腺增生，会使甲状旁腺组织异常增生，从而分泌过多的甲状旁腺激素。
继发性甲状旁腺功能亢进的原因
慢性肾功能不全： 当肾脏功能受损时，肾脏排磷减少，导致血磷升高，血钙降低。为了维持血钙水平，甲状旁腺会受到刺激而增生，进而分泌过多的甲状旁腺激素。据统计，在慢性肾功能不全患者中，相当一部分会逐渐发展为继发性甲状旁腺功能亢进。维生素D缺乏或抵抗： 比如长期日照不足、饮食中维生素D摄入过少等导致维生素D缺乏时，会影响钙的吸收，使血钙降低，刺激甲状旁腺增生分泌更多激素。而维生素D抵抗则是机体对维生素D的作用不敏感，也会引发甲状旁腺的代偿性增生和激素分泌增多。
三发性甲状旁腺功能亢进的原因
在继发性甲状旁腺功能亢进的基础上，由于长期的刺激，甲状旁腺组织由代偿性增生转变为自主性分泌功能亢进，即使血钙已经正常或降低，仍持续分泌过多的甲状旁腺激素，就发展为三发性甲状旁腺功能亢进。例如一些慢性肾功能不全患者经过长期透析等治疗后，可能会出现这种情况。