间质性肺炎的病因较为复杂，可能由多种因素引起。比如，约有30%的特发性间质性肺炎病因不明，而有的则与环境因素、自身免疫性疾病等有关。
环境因素相关
职业环境接触： 长期接触石棉的人，患间质性肺炎的风险会明显增加。比如在石棉开采、加工等工作环境中，工人吸入石棉纤维后，肺部容易受到损伤，进而引发间质性肺炎。另外，长期接触粉尘，像煤矿粉尘、石英粉尘等，也可能导致间质性肺炎的发生。工人在煤矿作业时，如果防护措施不到位，吸入大量煤矿粉尘，就可能逐渐引发肺部的间质性病变。室内环境因素： 长期暴露于污染的室内空气环境中也可能相关。比如室内燃烧生物质燃料（如柴草、煤炭等）产生的烟尘，其中含有多种有害颗粒物和气体，长期吸入会对肺部造成损害，增加间质性肺炎的发病几率。还有一些新装修的房屋，装修材料释放的甲醛等有害化学物质，长时间接触也可能影响肺部健康，增加间质性肺炎的发生风险。
自身免疫性疾病相关
类风湿关节炎相关： 约有10% - 20%的类风湿关节炎患者会并发间质性肺炎。类风湿关节炎是一种自身免疫性疾病，免疫系统错误地攻击关节等部位，同时也可能累及肺部，导致肺部出现间质性炎症改变。患者除了有关节疼痛、肿胀等类风湿关节炎的表现外，还可能出现咳嗽、气短等间质性肺炎的症状。系统性红斑狼疮相关： 系统性红斑狼疮患者也有一定概率并发间质性肺炎。系统性红斑狼疮是累及多系统的自身免疫性疾病，当累及肺部时，会引起肺部的间质性病变，影响肺部的正常功能，患者可能出现呼吸困难、咳嗽等症状，严重影响生活质量。
药物因素相关
某些化疗药物： 一些用于治疗癌症的化疗药物可能会引发间质性肺炎。比如博来霉素，在使用博来霉素进行化疗的患者中，约有1% - 10%会出现间质性肺炎的不良反应。博来霉素导致间质性肺炎的机制可能与药物引起肺部的氧化应激反应、炎症损伤等有关。部分心血管药物： 某些心血管药物也可能导致间质性肺炎。例如胺碘酮，长期服用胺碘酮的患者中，约有1% - 17%会发生间质性肺炎。胺碘酮引起肺部病变的具体机制尚不完全明确，可能与药物在肺部的蓄积、引起炎症反应等有关。