间质性肺炎的病因较为复杂，可能由多种因素引起。比如约有30%的间质性肺炎病因不明，而有的则与环境因素、自身免疫性疾病等有关。
环境因素相关
职业环境暴露： 长期接触石棉、煤尘、谷物粉尘等职业性粉尘的人群，患间质性肺炎的风险会增加。比如在石棉加工厂工作的工人，由于长期吸入石棉纤维，肺部容易受到损伤，进而引发间质性肺炎。室内环境因素： 长期暴露于室内污染环境中也可能致病，像室内的霉菌污染，一些家庭环境潮湿，容易滋生霉菌，人吸入霉菌孢子等物质后，可能影响肺部健康，增加间质性肺炎的发生几率。
自身免疫性疾病相关
类风湿关节炎相关： 约有10% - 30%的类风湿关节炎患者会合并间质性肺炎。类风湿关节炎是一种自身免疫性疾病，免疫系统错误地攻击关节等部位，同时也可能累及肺部，导致间质性肺炎的出现，患者除了关节症状外，还会有咳嗽、气短等肺部受累的表现。系统性红斑狼疮相关： 系统性红斑狼疮患者也有发生间质性肺炎的可能，这种自身免疫性疾病会累及多个系统，当累及肺部时，就可能引发间质性肺炎，患者可能出现发热、皮疹、关节痛以及咳嗽、呼吸困难等症状。
药物因素相关
某些化疗药物： 一些用于治疗癌症的化疗药物，如博来霉素等，在使用过程中可能会引起间质性肺炎。博来霉素在发挥抗癌作用的同时，可能对肺部组织产生毒性，导致肺部出现炎症反应，进而引发间质性肺炎，使用这类化疗药物的患者需要密切监测肺部情况。某些心血管药物： 个别心血管药物也可能导致间质性肺炎，比如胺碘酮，长期服用胺碘酮的患者有一定概率出现肺部的不良反应，其中就包括间质性肺炎，患者可能会出现干咳、进行性呼吸困难等症状。