甲状腺癌的病因目前尚未完全明确，但有一些相关因素被认为与它的发生有关。一般来说，甲状腺癌的发生是多种因素综合作用的结果。
一、遗传因素相关
家族遗传倾向： 约5%-10%的甲状腺癌患者具有家族遗传背景。比如一些遗传性综合征相关的甲状腺癌，像多发性内分泌腺瘤病2型等，这类患者携带特定的基因突变，使得患甲状腺癌的风险比普通人明显增高。研究发现某些特定的基因位点突变与家族性甲状腺癌的发生密切相关。儿童期有头颈部辐射暴露史： 儿童时期如果因良性疾病接受过头颈部的放射治疗，比如因扁桃体炎、痤疮等疾病进行过颈部X线照射等，会显著增加甲状腺癌的发病风险。有数据显示，儿童期头颈部接受过放射治疗的人群，甲状腺癌的发病率比无放射暴露人群高很多倍。
二、激素水平相关
雌激素影响： 女性甲状腺癌的发病率相对男性较高，这可能与雌激素有关。雌激素可能会刺激甲状腺细胞的增殖。在女性的青春期、妊娠期等雌激素水平变化较大的时期，甲状腺癌的发病可能会受到一定影响。不过具体的作用机制还在进一步研究中，但可以明确雌激素与女性甲状腺癌发病存在一定关联。促甲状腺激素（TSH）长期刺激： 长期的TSH过度刺激可能会促使甲状腺细胞增生，进而增加甲状腺癌的发生风险。例如，一些甲状腺肿患者如果长期存在TSH升高的情况，其发展为甲状腺癌的几率会比正常人高。
三、碘摄入异常相关
碘摄入过高或过低： 碘摄入与甲状腺癌的发生也有一定关系。碘摄入过高可能会影响甲状腺的正常生理功能，增加甲状腺癌的发病风险；而碘摄入过低，也可能导致甲状腺滤泡增生等改变，从而间接增加甲状腺癌的发生几率。比如在一些碘缺乏地区，甲状腺肿的发病率较高，同时甲状腺癌的发病率也可能会有一定变化；在一些沿海高碘地区，甲状腺癌的发病率也呈现出一定的上升趋势。