两个月宝宝睡觉老是摇头的原因包括：一、维生素D缺乏，多见于未补充或补充不足维生素D的宝宝，除摇头外还会有哭闹、多汗、睡眠不安稳、枕秃等表现，可通过补充维生素D、多晒太阳、适当户外活动来缓解；二、惊吓，部分宝宝受惊吓后会有睡觉摇头、夜间异常哭闹情况，安抚可缓解；三、宝宝所处环境温度过高或头部汗液多致头部不适，需摇头缓解；四、新生儿睡眠环境光线过亮或过嘈杂会影响夜间睡眠，需调整至合适状态。
一、维生素D缺乏：这是比较常见的原因之一。当宝宝没有得到足够的维生素D补充时，体内钙的吸收可能会受到影响。宝宝就可能出现一系列的不适症状，如哭闹不止，因为身体的不舒服而难以安静入睡；多汗，尤其是头部容易出汗，这会让宝宝感觉不适；睡眠不安稳，容易在睡梦中惊醒或翻动；枕秃，即宝宝经常摇头摩擦枕头的部位头发稀少。此时，及时给宝宝补充适量的维生素D，并保证宝宝有足够的晒太阳时间和适当的户外活动，有助于改善这些症状。
二、惊吓：宝宝如果受到突然的惊吓，可能会在睡觉时通过老是摇头以及夜间异常哭闹来表现其不安。这时候，家长给予充分的安抚，如轻轻抚摸、轻声安慰等，能帮助宝宝缓解这种不安情绪，从而减少摇头等行为。
三、环境因素：如果宝宝所在的环境温度过高，或者宝宝头部由于某些原因出了较多汗液，这会使宝宝的头部产生不适感，他们就会通过摇头的方式来试图缓解这种不适。所以，要注意保持宝宝所处环境的温度适宜，避免宝宝过热，并及时处理宝宝头部的汗液。
四、睡眠环境影响：过于明亮的光线和嘈杂的声音都会干扰新生儿的睡眠，导致他们睡眠质量下降，出现睡觉老是摇头等情况。对此，调整新生儿的睡眠环境，使其不过于明亮和嘈杂，为宝宝创造一个安静、舒适的睡眠环境是很重要的。
总的来说，两个月宝宝睡觉老是摇头的原因多样，必要时需及时带宝宝到医院就诊，以便明确原因并采取合适的治疗措施。