肛周脓肿主要是肛腺感染引发的，约90%的肛周脓肿由肛腺阻塞感染所致。肛腺开口在肛管直肠交界处的肛窦处，肛窦易受粪便损伤引发感染，进而累及肛腺，炎症蔓延就可能形成肛周脓肿。
一、肛腺感染相关因素
肛窦损伤： 粪便中的异物、粗糙粪便等容易损伤肛窦，据统计，约70%的肛周脓肿患者有明确的肛窦损伤史。比如长期便秘的人，排便时粪便过硬，就容易擦伤肛窦。肛腺阻塞： 肛腺分泌的液体本是起到润滑肛管的作用，但如果肛窦发生炎症，水肿的组织可能会阻塞肛腺导管，导致肛腺分泌的液体无法正常排出，从而在腺体内积聚，为细菌滋生创造了条件。
二、身体抵抗力因素
免疫力低下人群： 患有糖尿病等基础疾病的人，身体抵抗力相对较弱，约有10% - 20%的糖尿病患者容易并发肛周脓肿。因为高血糖环境有利于细菌生长繁殖，而且糖尿病患者伤口愈合能力较差，一旦发生肛窦感染，就更容易发展成肛周脓肿。长期使用免疫抑制剂者： 像器官移植后需要长期服用免疫抑制剂的患者，由于免疫系统被抑制，对细菌的抵御能力下降，发生肛周脓肿的风险比正常人高很多。
三、局部卫生因素
不注意肛门清洁： 平时不注重肛门局部清洁，肛门周围容易残留粪便等污染物，这些污染物会滋生大量细菌，增加肛周感染的几率。研究发现，每天肛门清洁次数少于1次的人群，肛周脓肿的发生率比每天清洁2次以上的人群高约5倍。久坐人群： 长时间久坐会使肛门局部血液循环不畅，局部抵抗力降低，而且久坐还会压迫肛门部位，影响肛腺的正常排泄，从而增加肛周脓肿的发病风险。比如一些司机、办公室职员等长期久坐的人群，就是肛周脓肿的高发人群之一。