牙周炎治疗用药需根据病情来定，常用的有抗生素类药物，比如甲硝唑，它能抑制厌氧菌生长，对牙周炎有一定治疗作用，但一般不建议长期大量使用。
抗生素类药物
甲硝唑： 主要针对牙周炎中的厌氧菌感染，能抑制细菌生长繁殖。不过，孕妇及哺乳期女性禁用，有血液系统疾病的患者也要谨慎使用。阿莫西林： 属于广谱抗生素，可用于牙周炎伴有感染的情况，能起到抗菌消炎的作用。但对青霉素过敏的人不能使用。
局部用药
米诺环素凝胶： 这是一种局部用的抗生素凝胶，直接涂抹在牙周袋内，能在局部发挥抗菌作用，减少牙周袋内的炎症和细菌数量，一般一周使用一次左右。碘甘油： 有杀菌、收敛的作用，可用于牙周炎导致的牙龈红肿、出血等情况，直接涂抹在牙龈缘部位，能缓解症状。
抗炎镇痛类药物
布洛芬： 当牙周炎引起较明显的疼痛时，布洛芬可以起到抗炎镇痛的作用，能缓解疼痛症状。不过，有消化道溃疡病史的人要慎用。对乙酰氨基酚： 也能用于减轻牙周炎带来的疼痛，它的副作用相对布洛芬来说可能小一些，但同样，严重肝肾功能不全的人要避免使用。牙周炎的药物治疗只是辅助手段，更重要的是进行牙周基础治疗，像洗牙、龈下刮治等。而且药物使用都需要在医生的指导下进行，不同病情适用的药物及用法都不一样，不能自行随意用药。同时，患者要注意保持口腔卫生，每天早晚正确刷牙，饭后漱口，这样才能更好地控制牙周炎的发展。