跑步时头痛可能是脑部缺氧、神经性头痛、颈椎病等原因所致，应依据实际情况予以处理。
一、脑部缺氧：
1.当跑步时间较长时，会使心肺功能负担显著加重，进而影响脑部氧气供应，导致脑部缺氧，引发头痛症状。
2.处理方法是立即停止跑步并充分休息，通常可有所缓解。
二、神经性头痛：
1.跑步时头痛可能属于神经性头痛，可能还伴有恶心、畏光等表现，严重时会对正常睡眠质量产生影响。
2.患者可遵循医嘱口服甲钴胺片、维生素B1片等营养神经的药物进行医治。
三、颈椎病：
1.颈椎病属于退行性病变，尤其对于长时间伏案工作者，易导致局部神经受压迫，也可能影响颈部血管血液供应，常伴随颈部僵硬、活动受限等症状，且可能导致跑步时头痛。
2.患者可按医嘱口服布洛芬缓释胶囊、塞来昔布胶囊等非甾体抗炎药来缓解症状。
总之，跑步时头痛的原因多样，要明确具体原因后采取针对性的处理措施。