12岁孩子发烧39度通常是因受凉或感染引起，可通过药物治疗加以改善。
一、受凉：12岁孩子一旦受凉，就会有发烧表现，可能还伴有腹泻、流鼻涕等症状。此时需尽快就医，医生一般会指导应用蒙脱石散来止泻，同时配合如布洛芬缓释胶囊、吲哚美辛片等退烧药物进行治疗。此外，要特别注意做好保暖措施，通常这样处理后相关症状会逐渐缓解。
二、感染：
1.若受到病毒或细菌感染，12岁孩子也会出现发烧39度的情况，还会有寒战、头晕等现象。这就需要及时进行检查以明确病原体，然后依据具体情况应用药物治疗。
(1)对于病毒感染的，可以采用抗病毒治疗，如使用阿昔洛韦颗粒、利巴韦林颗粒等药物。
(2)对于细菌感染导致的，则需要运用抗生素治疗，比如阿莫西林胶囊、头孢呋辛酯片等。一般在感染得到控制后，患者发烧的症状会逐渐减轻，体温也会慢慢降低。
所以，12岁孩子发烧39度时要尽快就诊，明确病因并进行针对性治疗。