肝内胆管结石的治疗需根据具体情况而定，对于无症状的肝内胆管结石，通常定期观察即可，每6~12个月进行一次超声等检查。而有症状或并发症的患者则需要积极治疗。
手术治疗方式
胆管切开取石术：这是比较传统的手术方法，通过手术切开胆管，直接取出结石。适用于结石数量较少、胆管狭窄不严重的患者。肝切除术：如果结石所在的肝脏段或叶发生萎缩、纤维化，且病变较为局限，可能需要进行肝切除术。比如结石长期导致局部肝脏组织损坏，切除病变肝组织能从根本上解决问题。
内镜治疗手段
内镜逆行胰胆管造影（ERCP）：通过口腔、食管、胃到达十二指肠乳头，插入导管至胆管，利用造影剂显示胆管情况，然后取出结石。对于胆总管有结石且肝内胆管结石继发胆总管结石的患者较为适用，但对于肝内较深处的结石可能效果有限。内镜下括约肌切开术（EST）：在ERCP基础上，切开十二指肠乳头括约肌，有助于取出结石，但术后要注意预防出血、感染等并发症。
保守治疗情况
药物缓解症状：当肝内胆管结石引起疼痛时，可使用解痉止痛药，如阿托品等，能缓解胆管痉挛带来的疼痛。但药物只能暂时缓解症状，不能去除结石。抗感染治疗：如果结石导致胆管炎，出现发热、腹痛等感染症状，需要使用抗生素进行抗感染治疗，常用的有头孢菌素类等抗生素，但要根据药敏结果合理选择。患者平时要注意保持良好的生活习惯，规律作息，合理饮食，避免高脂肪、高胆固醇食物的过多摄入，以减少结石的形成或复发风险。