母乳性黄疸的主要原因与母乳中的特定成分以及新生儿的代谢特点有关。首段来看，母乳性黄疸主要是因为母乳中的某些物质影响了新生儿胆红素的代谢，大约有1%左右的母乳喂养婴儿会出现母乳性黄疸。
母乳中的特殊成分影响
β-葡萄糖醛酸苷酶含量高：母乳中的β-葡萄糖醛酸苷酶含量相对较高，这种酶会使肠道内的结合胆红素又重新分解为未结合胆红素，使得肠道对未结合胆红素的重吸收增加，从而导致血液中未结合胆红素水平升高，引发黄疸。脂肪酶作用：母乳中的脂肪酶可能也参与其中，它会促进母乳中脂肪的分解，进而影响新生儿的胆红素代谢过程，使得胆红素的代谢出现异常，增加母乳性黄疸发生的几率。
新生儿的代谢特点因素
肠肝循环特点：新生儿的肠肝循环系统尚未发育完善，肠道内的胆红素排泄相对较慢。未结合胆红素经过肠道重吸收后，不能像成人那样有效代谢，就容易在体内堆积，导致黄疸持续时间较长，这也是母乳性黄疸产生的一个重要原因。胆红素代谢能力有限：新生儿的肝细胞对胆红素的摄取、结合和排泄功能还不够成熟。肝细胞摄取未结合胆红素的能力较弱，结合胆红素的能力也有限，排泄胆红素的功能相对不足，使得胆红素在体内积累，尤其是在母乳喂养的情况下，更容易出现母乳性黄疸。
个体差异相关因素
遗传因素影响：部分新生儿可能存在与胆红素代谢相关的遗传基因变异，使得他们对母乳中影响胆红素代谢的物质更为敏感，从而更容易发生母乳性黄疸。比如某些参与胆红素转运、代谢的基因发生突变，就会导致胆红素代谢过程出现障碍，引发黄疸。喂养方式相关个体差异：不同新生儿对母乳的适应情况不同，有些新生儿在母乳喂养后，胆红素的代谢反应更为明显，相比人工喂养的新生儿更容易出现母乳性黄疸。这可能与每个新生儿自身的代谢调节机制存在差异有关，导致对母乳中影响胆红素代谢的成分反应不同。