膜部室间隔缺损有一定自愈可能，一般小型膜部室间隔缺损在1岁内自愈率可达80%左右。
缺损大小与自愈的关系
小型膜部室间隔缺损：直径小于5毫米的膜部室间隔缺损，自愈的可能性相对较大。这类缺损对心脏血流动力学影响较小，宝宝的心脏有自我修复的机会。在出生后的1年内，很多宝宝的缺损会逐渐闭合。中型膜部室间隔缺损：直径在5~10毫米之间的中型膜部室间隔缺损，自愈的概率相对小型缺损要低一些，但仍有一定可能。一般观察到3岁左右，如果还未自愈，自行闭合的机会就比较小了。大型膜部室间隔缺损：直径大于10毫米的大型膜部室间隔缺损，自愈的可能性非常低。这类缺损对心脏的影响较大，通常需要通过医疗干预来解决。
年龄因素对自愈的影响
新生儿期：刚出生的宝宝，心脏还在不断发育中，膜部室间隔缺损有一定的自愈空间。这时候要密切观察，定期进行心脏超声检查，了解缺损的变化情况。婴幼儿期：1岁以内的婴幼儿，如果是小型膜部室间隔缺损，要持续关注。有些宝宝在这个阶段缺损就闭合了。但如果到了1岁还没闭合，后续自愈的几率会逐步降低。学龄前儿童期：3岁以后，膜部室间隔缺损自行闭合的可能性已经比较小了。这时候就需要根据具体情况考虑是否需要进行手术等治疗措施。
伴随症状与自愈的关联
无明显症状：如果宝宝膜部室间隔缺损没有引起明显的呼吸困难、生长发育迟缓等症状，自愈的可能性相对较高。因为没有明显症状说明心脏功能还能较好地代偿，心脏有机会自我修复缺损。有明显症状：当宝宝出现反复呼吸道感染、吃奶费力、生长发育落后等明显症状时，说明膜部室间隔缺损已经对心脏功能产生了较明显的影响，这时候自愈的可能性就比较小了，需要及时就医评估治疗方案。