上呼吸道感染大多由病毒引起，约70% - 80%由病毒导致，像鼻病毒、冠状病毒、流感病毒等都是常见的引发上呼吸道感染的病毒病原体。细菌感染也能引发上呼吸道感染，约20% - 30%的上呼吸道感染是细菌引起的，比如A组β溶血性链球菌、肺炎链球菌等。
病毒因素：常见病毒引发感染
鼻病毒感染：鼻病毒是引发普通感冒最常见的病原体之一，它很容易在人群密集的场所传播，比如学校、办公室等。当人体免疫力下降时，鼻病毒就容易侵入上呼吸道，导致鼻腔黏膜炎症，出现鼻塞、流涕等症状。流感病毒感染：流感病毒引起的上呼吸道感染往往起病较急，传染性更强。流感病毒分为甲型、乙型等类型，在流感流行季节，感染流感病毒后，患者通常会出现高热、头痛、全身酸痛等较为明显的全身症状，同时伴有上呼吸道的相关症状。
细菌因素：细菌感染导致发病
A组β溶血性链球菌感染：A组β溶血性链球菌可引发急性扁桃体炎等上呼吸道感染疾病。这种细菌感染后，扁桃体会出现明显的红肿、疼痛，有时还会有脓性分泌物渗出，患者可能伴有发热等症状。肺炎链球菌感染：肺炎链球菌可引起肺炎、中耳炎等多种疾病，当它侵袭上呼吸道时，也会导致上呼吸道感染相关症状，像咳嗽、咽痛等，严重时可能引发较为严重的并发症。
环境与个体因素：增加感染风险
环境因素：长期处于拥挤、通风不良的环境中，会增加上呼吸道感染的风险。比如在冬季，室内人员密集且通风差，病毒和细菌更容易在空气中传播，使人更容易感染上呼吸道感染。个体因素：自身免疫力低下的人群，比如老年人、儿童以及患有慢性疾病（如糖尿病、艾滋病等）的人，更容易受到病原体的侵袭而引发上呼吸道感染。另外，过度劳累、睡眠不足等也会影响人体的免疫力，增加感染上呼吸道感染的可能性。