三个多月的宝宝咳嗽，可能是生理性因素引起，也可能与支气管炎、肺炎等疾病有关，可采取一般治疗或药物治疗。
一、一般治疗：若咳嗽是生理性因素导致，通常无需过度治疗。日常可多给宝宝饮温开水，这有助于痰液排出。同时，也可适当让宝宝饮用冰糖雪梨水。此外，要避免宝宝处于污染严重的环境。
二、药物治疗：
1.支气管炎引起的咳嗽，可遵医嘱使用阿莫西林、氨溴索等药物进行治疗。
2.肺炎导致的咳嗽，可以在医生指导下使用头孢克肟、阿莫西林等药物进行治疗。
总之，当三个多月的宝宝出现咳嗽时，要明确具体原因，然后根据情况选择合适的治疗方法。