强直性脊柱炎的病因目前尚未完全明确，但多项研究表明，遗传因素是重要诱因之一。约90%的患者与人类白细胞抗原B27（HLA - B27）基因相关，携带HLA - B27基因的人群患病风险比普通人高10~20倍。
遗传因素方面
基因携带情况： HLA - B27基因检测是筛查强直性脊柱炎的重要指标，家族中有强直性脊柱炎患者的人，应关注自身HLA - B27基因状况。如果家族中有人患病，其他成员患强直性脊柱炎的概率会增加。遗传传递特点： 强直性脊柱炎的遗传不是简单的显性或隐性遗传，而是多基因参与的复杂遗传模式。父母一方携带HLA - B27基因，子女有一定概率遗传该基因从而增加患病风险，但不是必然发病。
感染因素影响
肠道感染关联： 某些细菌感染与强直性脊柱炎的发病有关，比如肺炎克雷伯菌。研究发现，强直性脊柱炎患者肠道中肺炎克雷伯菌的携带率明显高于正常人。这种细菌可能与人体自身组织有相似抗原，人体免疫系统在攻击细菌时误伤到自身关节组织，引发炎症反应，逐渐导致强直性脊柱炎的发生。泌尿生殖系统感染： 泌尿生殖系统的一些感染病原体，也可能通过免疫反应引发强直性脊柱炎相关的关节炎症。例如衣原体感染等，可能会激活免疫系统，使得关节部位出现炎症损伤，进而影响脊柱等关节结构。
免疫因素作用
免疫系统异常： 人体免疫系统失调时，会错误地攻击自身组织。在强直性脊柱炎患者体内，免疫系统会攻击脊柱、骶髂关节等部位的关节滑膜和周围组织，导致炎症产生，出现关节疼痛、僵硬、活动受限等症状。细胞因子参与： 多种细胞因子在强直性脊柱炎的发病中起作用，比如肿瘤坏死因子 - α（TNF - α）等。这些细胞因子会促进炎症反应的持续，使得关节炎症难以消退，进一步破坏关节结构，导致病情逐渐进展，影响患者的生活质量。