大便时出血、肛门疼痛可能由多种原因引起，以下是一些可能的原因：1.肛裂：肛管皮肤全层纵行裂开并形成感染性溃疡，多由便秘引起，典型表现为肛门疼痛、便血和便秘。肛裂引起的便血，颜色鲜红，量较少。肛门疼痛呈周期性，多在大便时或大便后加重
2.内痔：肛垫的支持结构、静脉丛及动静脉吻合支发生病理性改变或移位，内痔位于齿状线上方，表面覆盖黏膜，一般无疼痛，以便血、痔核脱出为主要症状。内痔早期，一般无疼痛，仅在排便后，肛门有团块脱出，但能自行回纳。随着内痔痔核增大，排便时，可使内痔脱出肛外，若发生嵌顿，可导致疼痛。内痔出血量较多，颜色鲜红
3.外痔：位于齿状线下方，表面覆盖皮肤，由痔外静脉丛曲张或肛缘皱襞皮肤发炎、肥大、结缔组织增生或血栓瘀滞而形成。外痔平时无特殊症状，发生血栓及炎症时，可有肿胀、疼痛。炎性外痔，自觉肛门部灼痛、湿痒，便后或活动过多后症状加重。血栓性外痔，肛门部剧烈疼痛，肛管皮下可见暗紫色肿物，有明显触痛。4.肛管或直肠肿瘤：肛管及直肠的良恶性肿瘤，早期可无明显症状，随着病情进展，可出现大便习惯改变、大便带血、肛门疼痛等症状。肛管癌，多见于肛管与肛门周围皮肤交界处，生长较慢，便血为主要表现，色鲜红，量不多，伴有肛门部瘙痒。直肠癌，早期无明显症状，病情进展后，可出现大便次数增多、大便带血、脓血便、里急后重、肛门下坠感等症状。5.其他原因：肛门部损伤，如肛裂、痔疮等手术后，伤口未愈合，排便时可导致疼痛和出血。肠道感染，如痢疾、溃疡性结肠炎等，可导致肠道炎症，引起肛门疼痛、便血。全身性疾病，如白血病、血小板减少性紫癜等，可导致凝血功能障碍，引起出血。如果出现大便时出血、肛门疼痛的症状，应及时就医，明确病因，以便进行针对性治疗。此外，在就医前，应注意保持肛门部清洁，避免食用辛辣刺激性食物，保持大便通畅。