三个月的宝宝咳嗽有痰，可采取以下措施：
1.多次少量喂水：有助于稀释痰液，促进痰液咳出。
2.经常改变体位：如侧卧、俯卧，经常抱起拍背，可促进痰液松动，便于痰液咳出。
3.保持适宜的室内温度和湿度：温度控制在18～22℃，湿度控制在60%左右，可使呼吸道黏膜保持湿润，有利于黏膜表面纤毛的摆动，帮助排痰。
4.排痰护理：对于不会咳痰的宝宝，家长可以在医生的指导下进行雾化吸入、吸痰等，以帮助排痰。
5.及时就医：如果宝宝咳嗽有痰的症状持续不缓解或加重，或出现发热、呼吸急促等异常情况，应及时就医，以明确病因，并在医生的指导下进行治疗。
需要注意的是，以上内容仅供参考。如果宝宝出现咳嗽有痰的症状，建议及时就医，以获得更专业的建议和治疗。