三个月宝宝咳嗽有痰，可采取以下措施。
1.观察宝宝的情况：注意宝宝的咳嗽频率、呼吸是否急促、是否有喘息、体温是否升高、精神状态等。如果宝宝出现呼吸急促、喘息、高热、精神萎靡等异常情况，应及时就医。
2.保持室内空气湿润：可以使用加湿器增加室内空气湿度，有助于缓解宝宝咳嗽有痰的症状。
3.拍背排痰：将宝宝竖着抱起，空心掌由下往上，由外向内拍背，促进痰液排出。每次拍背5-10分钟，每天拍2-3次。
4.多喝温水：多喝水有助于稀释痰液，促进痰液排出。
5.就医治疗：如果宝宝咳嗽有痰的症状持续不缓解或加重，应及时就医。医生会根据宝宝的具体情况，制定相应的治疗方案，可能包括药物治疗、雾化治疗等。
需要注意的是，三个月以下的宝宝咳嗽有痰，应及时就医，因为他们的咳嗽反射还不完善，不能有效地咳出痰液，容易导致痰液堵塞呼吸道，引起肺炎等并发症。同时，在就医过程中，应如实告知医生宝宝的情况，包括是否有过敏史、家族病史等，以便医生进行准确的诊断和治疗。