复杂性肛瘘是一种肛门直肠疾病，是肛瘘的一种类型。肛瘘是肛管或直肠与肛周皮肤相通的肉芽肿性管道，主要侵犯肛管，很少涉及直肠，故常称为肛瘘，多由肛管直肠周围脓肿引起。其特点为瘘管多较深、复杂，支管和空腔多，常有支管交叉，外口多有多个，经久不愈，有恶变倾向。其病因及具体发病机制尚不完全清楚，可能与以下因素有关。
1.感染
肛管直肠周围脓肿是肛瘘的主要原因，多数肛瘘继发于肛管直肠周围脓肿。脓肿自行破溃或切开引流后，常形成肛瘘。
2.直肠肛门损伤
外伤、吞咽金属异物等损伤肛管直肠，细菌可经损伤处进入肛腺，引起肛腺感染，形成肛周脓肿，导致肛瘘。
3.肛裂
肛裂反复感染也可并发肛瘘。
4.会阴部手术
内痔注射、肛瘘手术、会阴侧切等手术，因操作不当或术后感染，也可导致肛瘘。
5.其他
克罗恩病、结核病、溃疡性结肠炎等特异性炎症、恶性肿瘤、肛管外伤等也可导致肛瘘。
肛瘘不能自愈，不治疗会反复发作直肠肛管周围脓肿，因此，肛瘘一旦确诊，应及时手术治疗。手术治疗原则是将瘘管切开，形成敞开的创面，促使愈合。手术方式很多，手术应根据内口位置的高低、瘘管与肛门括约肌的关系来选择。复杂性肛瘘手术较复杂，术后恢复时间较长，术后还可能出现肛门失禁等并发症。
总之，复杂性肛瘘是一种比较严重的肛肠疾病，需要及时就医，进行规范治疗。