手指甲凹凸不平有很多小坑，可能是以下原因引起：
1.银屑病：银屑病是一种慢性炎症性皮肤病，可累及指甲，导致指甲出现凹陷、增厚、变色等异常。
2.扁平苔藓：扁平苔藓是一种皮肤黏膜慢性炎症性疾病，也可影响指甲，出现甲板变薄、凹陷、纵嵴等改变。
3.斑秃：斑秃是一种自身免疫性疾病，可导致头发和指甲的异常。部分斑秃患者可出现指甲上的小坑。
4.湿疹：湿疹是一种常见的皮肤病，可引起皮肤的瘙痒、红肿、脱屑等症状。长期的湿疹病变可能影响指甲的生长，导致指甲出现凹凸不平。
5.感染：某些细菌、真菌或病毒感染也可能导致指甲的改变，如灰指甲、甲沟炎等。
6.营养不良：维生素、矿物质等营养素缺乏可能影响指甲的健康，导致指甲出现小坑、变薄等问题。
7.其他：系统性疾病如心脏病、糖尿病、银屑病关节炎等，以及药物副作用等也可能引起指甲的异常。
需要注意的是，以上只是一些可能的原因，指甲凹凸不平的具体原因还需要结合患者的病史、症状、体征以及实验室检查等综合判断。如果发现手指甲有异常，建议及时就医，以便明确诊断并采取相应的治疗措施。
对于儿童和老年人，如果出现手指甲凹凸不平，需要特别关注，因为某些疾病在这两个群体中可能表现得更为隐匿。此外，孕妇在怀孕期间由于体内激素水平的变化，也可能出现指甲的异常，需要及时就医咨询。
在就医时，医生通常会进行详细的身体检查和询问病史，可能会建议进行一些实验室检查，如血常规、微量元素检测、真菌涂片或培养等，以帮助明确病因。治疗方法将根据具体病因而定，可能包括外用药物、口服药物、光疗或其他治疗方法。
同时，保持良好的生活习惯和指甲护理也有助于改善指甲的健康。保持指甲清洁，避免过度修剪或使用刺激性的指甲油、清洁剂等。均衡饮食，摄入足够的营养物质，对于维持指甲的健康也非常重要。
总之，手指甲凹凸不平有很多小坑可能是多种疾病的表现，需要及时就医，以便获得正确的诊断和治疗。同时，关注自身健康，保持良好的生活习惯，对于预防指甲问题的发生也至关重要。