高烧39℃不退的原因可能有以下几种：
1.感染性疾病：是导致发热最常见的原因，如细菌、病毒、真菌等感染均可引起发热。其中，细菌感染较为常见，如肺炎、扁桃体炎、胆囊炎等；病毒感染如流感、手足口病等；真菌感染如念珠菌病等。
2.非感染性疾病：
自身免疫性疾病：如系统性红斑狼疮、类风湿关节炎等，可导致免疫系统异常，攻击自身组织，引起发热。
恶性肿瘤：某些恶性肿瘤如白血病、淋巴瘤等，可导致身体发热。
药物热：某些药物如抗生素、抗抑郁药等，可引起过敏反应或药物热。
其他：如中暑、输血反应、结缔组织病等也可引起发热。
3.其他原因：
体温调节中枢功能障碍：如脑出血、脑外伤、严重感染等，可导致体温调节中枢功能障碍，出现高热。
内分泌疾病：如甲状腺功能亢进、肾上腺皮质功能减退等，可导致产热增加，出现发热。
环境因素：在高温环境下或剧烈运动后，可出现发热。
需要注意的是，高烧39℃不退可能是严重疾病的表现，应及时就医，进行详细的检查和诊断，以确定病因，并采取相应的治疗措施。在就医前，可先采取物理降温措施，如冷敷、温水擦浴等，同时注意休息，多饮水，以补充因发热导致的水分丢失。