大拇指指甲凹凸不平，可能是以下原因引起：
1.营养不良：指甲是由蛋白质组成，如果身体缺乏某些营养素，如蛋白质、铁、钙、维生素等，可能会导致指甲凹凸不平。
2.真菌感染：真菌感染是指甲病变的常见原因之一，如灰指甲。真菌感染会导致指甲变厚、变色、变形，甚至出现凹凸不平的情况。
3.银屑病：银屑病是一种自身免疫性疾病，可能会影响指甲的健康，导致指甲出现凹陷、凸起、变色等异常。
4.扁平苔藓：扁平苔藓是一种慢性炎症性皮肤病，也可能会影响指甲的生长，导致指甲凹凸不平。
5.外伤：指甲受到外伤，如挤压、碰撞等，可能会导致指甲下出血，从而引起指甲凹凸不平。
6.其他疾病：某些疾病，如心脏病、糖尿病、甲状腺功能异常等，也可能会影响指甲的健康，导致指甲出现异常。
如果发现大拇指指甲凹凸不平，建议及时就医，进行相关检查，以确定具体原因。医生可能会建议进行以下检查：
1.血液检查：检查身体是否缺乏某些营养素，或是否存在其他健康问题。
2.真菌检查：如果怀疑是真菌感染，医生可能会进行真菌检查，以确定是否存在真菌感染。
3.皮肤镜检查：医生可能会使用皮肤镜检查指甲表面和周围的皮肤，以确定是否存在银屑病或扁平苔藓等疾病。
4.其他检查：根据具体情况，医生可能会建议进行其他检查，如心电图、血糖、甲状腺功能等检查，以排除其他潜在的健康问题。
治疗方法取决于具体原因。以下是一些常见的治疗方法：
1.补充营养：如果是营养不良导致的指甲凹凸不平，医生可能会建议补充缺乏的营养素，如蛋白质、铁、钙、维生素等。
2.抗真菌治疗：如果是真菌感染导致的指甲凹凸不平，医生可能会开处方药物进行治疗，如外用抗真菌药物或口服抗真菌药物。
3.治疗原发疾病：如果指甲凹凸不平是其他疾病的症状之一，治疗原发疾病是关键。例如，治疗银屑病、扁平苔藓等疾病，可能会改善指甲的健康状况。
4.保护指甲：在治疗期间，应注意保护指甲，避免受到外伤和感染。可以使用指甲油或保护剂来保护指甲，避免指甲受到摩擦和损伤。
5.定期复诊：治疗期间，需要定期复诊，医生会根据病情的恢复情况调整治疗方案。
需要注意的是，指甲的生长周期较长，治疗需要一定的时间。在治疗期间，应保持耐心，按照医生的建议进行治疗和护理。同时，如果指甲凹凸不平的情况持续加重或伴有其他症状，如疼痛、肿胀、变色等，应及时就医，以便及时诊断和治疗。此外，对于一些特殊人群，如孕妇、儿童、老年人等，指甲凹凸不平的原因和治疗方法可能会有所不同，需要在医生的指导下进行治疗。