大拇指指甲凹凸不平可能是由以下原因引起的：
1.营养不良：指甲是由蛋白质组成的，如果身体缺乏蛋白质、维生素或矿物质等营养物质，指甲就可能会出现凹凸不平的情况。
2.真菌感染：灰指甲是由真菌感染引起的，会导致指甲变厚、变色、变形，甚至出现凹凸不平的情况。
3.外伤：指甲受到外力撞击、挤压或切割等损伤，可能会导致指甲下出血、变形，从而出现凹凸不平的情况。
4.疾病：某些疾病也可能会导致指甲凹凸不平，如银屑病、扁平苔藓、湿疹等皮肤病，以及缺铁性贫血、心脏病等全身性疾病。
5.药物副作用：某些药物的副作用可能会导致指甲出现异常，如化疗药物、抗抑郁药等。
如果发现大拇指指甲凹凸不平，建议及时就医，进行相关检查，以确定具体原因。如果是营养不良引起的，可以通过调整饮食来改善；如果是真菌感染引起的，需要使用抗真菌药物进行治疗；如果是外伤导致的，需要注意保护指甲，避免再次受伤；如果是疾病引起的，需要积极治疗原发病；如果是药物副作用引起的，需要咨询医生是否需要调整药物剂量或更换药物。