同房后第二天起来腰疼可能与以下原因有关：
1.肌肉疲劳：同房时需要使用腰部肌肉，尤其是男性在同房时需要进行腰部的运动，如果动作过于剧烈或持续时间过长，可能导致腰部肌肉疲劳，引起疼痛。
2.姿势不当：同房时的姿势不当，如弯腰、扭曲等，可能导致腰部肌肉或韧带受到牵拉或扭伤，引起疼痛。
3.盆腔炎：女性在同房时，若没有注意卫生，可能会导致细菌上行感染，引起盆腔炎。盆腔炎可导致盆腔充血、水肿，从而刺激腰部神经，引起腰疼。
4.其他：同房时动作过于激烈，可能导致腰椎间盘突出、肾结石等疾病发作或加重，从而引起腰疼。
需要注意的是，以上只是一些可能的原因，腰疼还可能与其他因素有关。如果腰疼症状持续不缓解或伴有其他不适，建议及时就医，进行详细的检查和诊断，以确定病因，并采取相应的治疗措施。
对于一些特殊人群，如孕妇、老年人等，同房后腰疼可能需要特别关注。孕妇在怀孕期间，由于激素水平的变化和身体重心的改变，容易出现腰疼。在同房时，需要注意姿势和力度，避免对胎儿造成影响。老年人可能存在腰椎间盘突出、骨质疏松等问题，同房时更要注意腰部的保护。
总之，同房后腰疼可能是正常的生理反应，但也可能是某些疾病的表现。如果出现腰疼症状，建议及时就医，以便早期诊断和治疗。同时，在同房时，应注意姿势和力度，避免过度劳累和受伤。