怀孕初期流血并伴有肚子疼，可能是以下原因引起：
1.先兆流产：怀孕初期，胚胎着床不稳定，过度劳累、性生活、孕酮值低等因素可能导致先兆流产，出现阴道流血、下腹疼痛等症状。此时需要及时就医，医生一般会建议卧床休息、使用黄体酮等药物进行保胎治疗。
2.宫外孕：受精卵在子宫体腔以外着床称为宫外孕，以输卵管妊娠最常见。宫外孕时，随着孕囊的生长，会导致输卵管破裂，引起腹腔内出血，出现剧烈腹痛、阴道流血等症状。宫外孕是一种非常危险的情况，需要及时就医，通过手术或药物治疗。
3.葡萄胎：葡萄胎是一种良性妊娠滋养细胞疾病，与卵子或精子的异常有关。停经后阴道流血是葡萄胎的主要症状，多为间歇性少量出血，还可能伴有子宫异常增大、变软，血清HCG水平异常升高等。确诊后需要及时清宫，并定期复查。
4.其他：怀孕初期，宫颈息肉、宫颈癌等也可能导致阴道流血伴腹痛。此外，剧烈的运动、碰撞等也可能引起先兆流产。
总之，怀孕初期出现阴道流血并伴有肚子疼，需要引起重视，及时就医，明确原因，并采取相应的治疗措施。同时，在怀孕前3个月，要注意休息，避免劳累和性生活，保持心情愉快，按时进行产前检查。