舌头根部两侧疼可能是以下原因引起：
1.感染：细菌、病毒或真菌等感染都可能导致舌头根部疼痛。例如，链球菌性咽炎、口腔念珠菌感染等。
2.溃疡：舌头根部的溃疡可能是由于营养不良、压力、免疫系统问题或其他原因引起的。口腔溃疡通常会在几周内自行愈合，但严重的溃疡可能需要治疗。
3.过敏：对某些食物、药物或口腔清洁用品过敏可能导致舌头根部疼痛和肿胀。
4.口腔损伤：咬伤、烫伤或其他口腔损伤也可能导致舌头根部疼痛。
5.自身免疫性疾病：某些自身免疫性疾病，如系统性红斑狼疮或干燥综合征，可能影响口腔组织，导致舌头根部疼痛。
6.其他原因：舌头根部疼痛还可能与神经痛、恶性肿瘤、放射性损伤等有关。
针对舌头根部两侧疼的问题，可以尝试以下解决方法：
1.保持口腔清洁：使用软毛牙刷和温和的漱口水清洁口腔，避免使用刺激性的漱口水。
2.避免刺激性食物和饮料：避免食用辛辣、酸性、油腻或过热的食物和饮料，以免刺激舌头根部。
3.多喝水：保持身体充足的水分摄入，有助于缓解口腔干燥和疼痛。
4.注意休息：充足的睡眠和减少压力有助于提高免疫力，缓解疼痛。
5.就医诊断：如果疼痛持续时间较长、严重或伴有其他症状，如发热、吞咽困难等，应及时就医。医生可能会进行口腔检查、血液检查或其他相关检查，以确定疼痛的原因，并制定相应的治疗方案。
需要注意的是，以上方法仅为缓解疼痛的建议，如果疼痛持续不减或加重，应及时就医。此外，对于长期存在的舌头根部疼痛，尤其是伴有其他异常症状的情况，应进行进一步的检查和诊断，以排除潜在的严重疾病。