舌根两侧疼痛可能是多种原因引起的，以下是一些可能的原因：
1.感染：细菌、病毒或真菌等感染都可能导致舌根两侧疼痛。例如，链球菌性咽炎、扁桃体炎等感染性疾病常伴有舌根疼痛。
2.口腔溃疡：口腔溃疡是一种常见的口腔黏膜疾病，可发生在舌根两侧。溃疡表面会出现红肿、疼痛等症状。
3.过敏：对某些食物、药物或口腔清洁用品过敏可能导致舌根两侧疼痛。过敏反应可能引起舌头肿胀和疼痛。
4.损伤：咬伤、烫伤或过度使用舌头等可能导致舌根两侧的损伤和疼痛。
5.口腔干燥：口腔干燥会导致口腔黏膜不适，包括舌根两侧疼痛。
6.其他口腔疾病：如舌炎、口腔白斑等也可能引起舌根疼痛。
7.全身性疾病：某些全身性疾病，如糖尿病、贫血、维生素缺乏等，可能影响口腔健康，导致舌根疼痛。
8.神经痛：舌咽神经痛等神经病变也可能引起舌根两侧的疼痛。
如果舌根两侧疼痛持续时间较长、症状严重或伴有其他不适，如发热、吞咽困难、呼吸困难等，建议及时就医。医生会进行详细的口腔检查和评估，可能会建议进行进一步的检查，如血液检查、影像学检查等，以确定具体的病因并制定相应的治疗方案。
在等待就医期间，可以尝试以下方法缓解疼痛：
1.保持口腔清洁，使用温盐水漱口。
2.避免食用辛辣、刺激性食物和酸性饮料。
3.保持充足的水分摄入，避免口腔干燥。
4.避免过度使用舌头或刺激舌根。
5.注意休息，避免过度劳累。
需要注意的是，自我诊断和治疗可能会延误病情，因此最好在医生的指导下进行治疗。此外，对于长期存在的舌根疼痛，尤其是伴有其他异常症状的情况，应引起重视并及时就医。