阴茎上面皮肤长小水泡可能由多种原因引起，以下是一些可能的原因：
1.生殖器疱疹：由单纯疱疹病毒（HSV）感染引起，主要通过性接触传播。感染后，会在阴茎、龟头、冠状沟等部位出现水疱、溃疡，并伴有疼痛、瘙痒等症状。生殖器疱疹容易复发，需要长期控制。
2.水痘-带状疱疹病毒感染：水痘带状疱疹病毒感染后，潜伏在神经节内，当免疫力下降时，病毒可被激活，沿感觉神经纤维移至皮肤，发生带状疱疹。带状疱疹通常出现在身体的一侧，表现为红斑、水疱，并伴有疼痛。
3.接触性皮炎：由于接触某些过敏原或刺激物，如避孕套、润滑剂、某些化学物质等，导致阴茎皮肤过敏或炎症，出现水疱、红肿、瘙痒等症状。
4.药疹：某些药物可能引起过敏反应，导致阴茎皮肤出现水疱、皮疹等症状。
5.其他原因：如细菌感染、真菌感染、梅毒、软下疳等也可能引起阴茎皮肤病变。
需要注意的是，以上只是一些常见的原因，具体原因需要根据个人情况、症状特点、实验室检查等综合判断。如果出现阴茎皮肤长小水泡的情况，应及时就医，进行相关检查，以明确诊断，并采取相应的治疗措施。
对于特殊人群，如孕妇、免疫力低下者、性伴侣较多者等，应更加重视阴茎皮肤病变的情况，及时就医，遵循医生的建议进行治疗和预防。同时，保持良好的个人卫生习惯，避免不洁性行为，有助于减少感染的风险。